DXFデータをインポートされたと思われますが、書き出しの際の円弧出力計算時にずれが発生したものだと思います。

FoldUP! 3Dはデータ同士が離れている場合、誤差にて修正がかけられますが、このデータでは修正範囲外のデータの為、閉じられた図形だと認識されなかったようです。

再度確認の上、インポートをしてみてください。